分水墩在烏鎮北柵街區外，車溪、爛溪和橫涇港交匯處偏東，故說它分水，名副其實。最早沒有建樓閣，僅是一個水中的高阜地，“墩”者土丘也，據說是早年的“風水”設施。它地處三水之匯，又是昔日兩省、三府、七縣的分界處，所以地理位置就十分顯要。

三水匯合處，水面開闊、水流湍急，大旱不涸，風起浪涌，歷來為行船險要之處。土墩始于何年，文史無考。據載，“宋盛時，水口設有羅星”，指示航行。明萬歷初年（1573），同知羅斗聽信“風水先生”的講義，認為此“地為兩鎮之尾閭，須設關攔以固風氣”。于是倡興在墩上造閣，供文昌君像。文昌君又名文昌星，是主宰人世功名、利祿的尊神，也是致力讀書進仕者的偶像。羅斗官譽不錯，此舉更合兩鎮民眾的心意，銀兩建材迅速籌備。將舊有土墩“稍拓而東，筑石埠，四周繞以石欄”，“閣下蕭龍王像”。蕭龍王主宰內河、湖、泊水政，可策行船安全。以此推測，當年墩上建的是樓閣，于明萬歷九年六月竣工。

以后同知全廷訓、于琨、憲副徐汝澤都倡捐修葺，這些地方官都把維護分水墩當作“以固風氣”為民造福的好事。后徐冠南于民國八年（1919）倡修壽圣塔之余，重建分水墩，里人盧學溥等力助其成。

歷經區域和建制變更，而今是兩省、三府（市）依舊，縣境卻已由早先的七縣變成吳江、嘉興、吳興（現稱湖州）、桐鄉四市。